当问起农民在种植中最关心的问题时，得到的回答几乎是一样的，那就是病虫害防治和植物营养问题。解决病虫害和营养问题，现在最直接的方法是使用农药和化肥。农药和化肥的使用也是解决粮食安全问题最直接的手段，体现在具体数据上就是我国在占世界7%的耕地上使用了世界32%的化肥，世界第一！而按每公顷施肥量计算，世界平均为121公斤，我国则为455公斤，远远高出国际公认的225公斤的安全上限，是世界水平的3.75倍，即使考虑到我国耕地复种指数高，我国大田作物的施肥水平也超过300公斤。正是因为国外是轮耕，而我国耕地复种频繁，化肥和农药超量使用，更使得土壤环境越来越差，问题频出。

　　我国同样也是世界第一农药生产和使用大国，2014年我国农药产量350万吨左右，除去小部分出口，其余全部用于7%的耕地上。单位面积化学农药的平均用量比世界平均用量高2-3倍，在复耕和保护地上的使用量甚至高出4-5倍。每年遭受残留农药污染的作物面积达12亿亩，同时有大量的农药残留在土壤中，造成土壤环境进一步恶化。

　　近些年来，各地作物出现了原先没有见过的各种复杂病害，而且有愈演愈烈的趋势，很多专家也没有很好的解决办法。有些病害看似和某类病害的症状相同，可是用对应的农药防治，效果甚微。最典型的是柑橘黄龙病，笔者认为黄龙病虽然是一个很难防治的病害，但现在很多地方柑橘出现的类似黄龙病的症状，并不一定是真正的黄龙病，应该是由于化学农业综合症引起的黄叶病。很多地区的柑橘因为黄叶症状，无法找到防治的办法，被定性为黄龙病而被成片砍伐，仅广西恭城县就有近35万亩的椪柑、沙田柚和橙子被砍掉，造成严重的经济损失。

　　这么多的黄龙病防治专家，为什么一直没有给出真正解决黄龙病的方案呢？我认为其中很大一部分原因是专家太过注重研究果树地上发病部分，而忽视地下土壤环境和养分吸收问题。柑橘吸收养分和水分主要靠根部，土壤通透性、氮磷钾和中微量元素的合理性、有机物和微生物菌群的多少都会对吸收养分造成影响，而农药和除草剂的习惯性过量使用也会对树叶造成影响，从而造成黄叶。而黄叶并非都是黄龙病，把解决不了的黄叶问题归结于黄龙病也是不科学的，要充分考虑化学农业综合症的影响。这种黄叶病症状也在苹果和梨树等果树上陆续出现，很多地方还是当作缺素这症等原因来防治，而防治效果各有不同，相信将来也会出现同柑橘黄叶病类似的复杂情况。

　　还有一个不太被人重视的领域有可能会造成另一种化学农业综合症，那就是“看不见”的重金属污染已成为我国农产品的“隐形杀手”。而造成这种污染的一个来源是有机肥，现在有的有机肥原料来源各有不同，有工业原料废渣和污泥等，存在各种重金属污染，无人监督，似乎成了一个盲区。有机肥不一定有机，这已经成为一个被人忽视的，影响农产品安全的潜在因素。

　　化肥过量使用会造成土壤酸化，进而会诱发土壤重金属离子活性的提高。土壤PH值每下降一个单位，重金属镉的活性就会提升100倍，增加骨痛病等疑难病症的患病风险。农药的过量使用更是直接影响农产品安全，从而直接威胁人类的身体健康。农业部环境保护科研监测所所长任天志说：“农业面源污染的最大特点是隐藏性、长期性和分散性，是农业生产各个环节各个过程中自觉或不自觉产生的，一般不被重视，我们要重新认识和重视起来。”